Galatasarays målvaktsproblem ble løst etter at Claudio Taffarel, som nylig hadde spilt VM-finale for Brasil, ble hentet til klubben før 1998-99-sesongen. Det unge talentet Hasan Şaş, ble også hentet som 21-åring fra Ankaragücü for 5 millioner euro.

I gruppe med Rosenborg i Champions League

Som sist sesong tok Fatih Terim laget til gruppespillet i Champions League. Galatasaray spilte 2-2 mot Juventus i første kamp, mens de slo Athletic Bilbao 2-1 etter scoring av Gheorghe Hagi på overtid. Etter det ventet et dobbelt oppgjør mot Rosenborg, som endte med 3-0-seier for hver av lagene på hjemmebane.

Galatasaray tok andreplassen i gruppen bak Juventus, men laget hadde for lite poeng til å gå videre som de to beste gruppetoerne.

Tok Beşiktaş i både ligaen og cupen

I ligaen og cupen kjempet Galatasaray mot Beşiktaş i begge turneringer. Galatasaray havnet på tabell-topp etter runde 22, og så seg etter det aldri tilbake. I den 31. serierunden møttes lagene til et avgjørende oppgjør. Galatasaray hadde, som for to sesonger siden, en luke på fem poeng ned til Beşiktaş før lagene møttes på Inonü stadion. Okan Buruk sendte Galatasaray i ledelsen fire minutter ut i kampen, men Mehmet Özdilek satte inn 1-1 for hjemmelaget i det 75. minutt. 1-1 ble også sluttresultatet og luken på fem poeng ble opprettholdt.

Galatasaray spilte uavgjort mot Antalyaspor og Gaziantepspor i de to siste kampene, men ble til slutt seriemester for tredje sesong på rad, to poeng foran Beşiktaş. Det var Galatasarays 13. seriemesterskap.

Det ble også revansje mot Beşiktaş, som de tapte cup-finalen mot sist sesong. Etter at første oppgjør endte 0-0 på Ali Sami Yen stadion, scoret Ümit Davala begge målene i 0-2-seieren på bortebane, og Fatih Terim tok «the double» med Galatasaray i 1998-99-sesongen.

Hakan Şükür toppscorer for tredje sesong på rad

Hakan Şükür ble toppscorer for tredje sesong på rad i ligaen med 19 ligamål, i tillegg til 12 målgivende pasninger. På tvers av alle turneringer scoret han 26 mål og hadde 13 målgivende pasninger på 47 kamper. Gheoeghe Hagi hadde også en god andre-sesong med 18 mål og 10 målgivende pasninger på 48 kamper, på tvers av alle turneringer, der 14 mål og 10 målgivende pasninger kom i ligaen.